本科生培养遵循“宽口径、厚基础、小规模、国际化”的原则，突出“通（通才教育）、专（专业人才）、新（创新创业）”的特色，建立了由专业教育、通识教育、个性化教育构成的本科培养体系，专业课程体系和标准与世界一流大学接轨。

截至2017年9月，上海科技大学已建立145个研究组，科研工作全面开展，学校科研人员共参与发表科研论文1379篇，其中上科大为第一单位598篇，“成功解析人源大麻素受体三维结构”等高水平科研成果开始涌现。